废水中的磷酸盐可以在合适的pH条件下，与某些金属离子形成不溶性的盐而被去除，如钙、铝、铁等。其中氯化锌可以说是非常有效的，可以做近似定量的去除，且可以在较低pH下操作。
对于一些低氧化态的磷酸盐，如亚磷酸盐、次磷酸盐、焦磷酸盐及连二磷酸盐、其钙盐等溶解度相对较大，可以先用氧化剂将这些盐类氧化成正磷酸盐。 再用常规的沉淀法进行处理。如可以通入氯气，经氧化后，再用石灰处理。
1、铁、铝盐沉淀法
废水中的焦磷酸及三聚磷酸可以用铁盐或铝盐在氢氧化钙存在下进行沉淀去除，其效果要比去除原磷酸好。其工作pH以7.5～9.5为好，FeCL3-Ca(OH)2产生的沉淀其沉降性能要比AL2(SO4)3-Ca(OH)2产生的沉淀好。当原水中含原磷酸10mg/L，焦磷酸4mg/L及三聚磷酸6mg/L时，铁或铝的用量与磷为等物质的量，氢氧化钙的用量为150mg/L时，其上清液中的磷的含量约为1mg/L。如再经砂滤，磷的含量可以降至0.6mg/L，而在最初的8h内，磷的含量可以降至0.2mg/L以下，如以砂及土壤代替砂，则在24h后，出水中的磷还可以保持在0.3mg/L左右。另有报道用三价铁进行磷酸盐的去除，可以在pH4～8.0的条件下进行，在不同的pH条件下所产生的沉淀，其过滤性能各有不同，其中尤以5.5～8.0时产生的沉淀最难沉降或过滤。
硫酸亚铁也可作为磷酸盐的沉淀剂，200mg/L的磷酸盐约需3000mg/L的硫酸亚铁。
用铝盐处理城市污水中的磷，如结合投加0.3mg/L的10%～20%水解的聚丙烯酰胺可以明显改善沉淀的沉降性能，并有90%的磷去除率。当不加聚丙烯酰胺时，不管是铝盐，还是铁盐及氢氧化钙，产生的沉淀都是一些类似胶体的非沉降性物质。
用铁盐或铝盐进行磷酸盐的沉淀，加人高分子絮凝剂可以提高去除效率。可以加入阴离子聚丙烯酰胺，也可以加入聚二烯丙基二甲基氯化铵作为助剂，可以提高去除效果。含磷生化出水可以用硫酸铝进行处理 · 并加人水溶性阳离子聚电解质，如丙烯酰胺-(2-丙烯酰氧乙基)二乙基甲基氯化铵甲基硫酸盐的共聚物，可以改善其去除效率。
2、钙、镁盐沉淀法
由于磷酸钙盐的溶解度较小，所以钙盐沉淀法是最常用的去磷技术，同样为了够取得最好的效果，所以在沉淀过程中加入晶种的方法是非常重要的。晶种用得最多的是磷矿石，当含磷酸盐的废水中同时存在铝时，也可以磷酸铝作为晶种，或作为填料，在用沉淀法处理后，进行过滤，可以获得更好的出水水质。用钙盐法沉淀废水中的磷酸盐后，可以用气浮的方法进行分离，并不会产生过多的污泥。
3、含磷废水也可用下述4步骤法处理
1.加入氢氧化钙的浆状物或水溶液，将pH调整至9.9～10.5；
2.加入氯化钙，使Ca2+/PO43-的摩尔比为(1.1～1.4)：1；
3.混合；
4.通过沉淀分离，在混合沉淀前如加入聚丙烯酰胺则效果更好，沉淀反应可即时发生，且不需过量钙离子的加入。
当废水中的磷酸盐浓度较高时，用钙盐法从经济上及效果上都比铁盐法为优，特别可以避免铁盐的腐蚀作用。
石膏或无水石膏可以作为磷酸盐的絮凝剂，如将一含5mg/L的NaH2PO4溶液，与一几乎饱和的无水石膏的溶液作用，搅拌10min后，并用氢氧化钠将pH调整至7，出水中有99.8%的磷酸二氢钠被去除。
碱性镁盐可以用来处理废水中的磷，如含10mg/L的磷酸盐废水，在pH为9~12时，可以用碱性碳酸镁处理，磷的去除率可达100%。
从钛白粉制造中产生的硫酸盐，其中含有硫酸铁、硫酸亚铁、硫酸铝、硫酸氧化钛、硫酸镁等，经处理后，可以成为废水中去除磷的药剂。如将1L含磷10mg/L (以磷酸二氢钠计)的废水加人130mg/L的该种药剂，经搅拌30min及沉降2h后，出水中的磷可以降至0.5mg/L，污泥体积11mL，污泥体积指数为160mL/g，而硫酸铝作为药剂，则出水中的磷为0.7mg/L，污泥体积22mL，污泥体积指数为420，明显差于该种药剂。
由于磷酸镁铵(MAP)的溶解度极小，所以可以用来处理含磷酸盐的废水。当将废水中的NH4+/PO43-摩尔比控制在1：1后，即可加人等摩尔的镁盐，反应可以在pH为9.5～10.5，其中尤以10的条件下进行为最好。但要达到有关排放标准，有时还较困难。处理也可以在一个反应器中进行，磷酸镁铵可以以圆粒形的固体回收，在反应开始时不需要加入晶种，所得的圆粒状固体极易风干，可以作为一种缓释肥料使用。
形成磷酸镁铵的方法处理含磷废水的方法，其中一个关键的问题是如何形成颗粒结实，易于过滤的沉淀，这可以通过特殊的设备进行循环形成上述性能的沉淀。
